Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRM3Q9NNZ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRM3Q9NNZ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms