Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9N2J8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9N2J8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9N2J8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9N2J8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9N2J8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9N2J8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9N2J8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9N2J8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9N2J8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9N2J8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9N2J8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9N2J8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9N2J8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9N2J8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9N2J8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9N2J8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9N2J8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9N2J8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9N2J8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9N2J8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9N2J8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9N2J8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9N2J8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9N2J8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9N2J8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9N2J8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9N2J8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9N2J8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9N2J8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9N2J8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9N2J8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9N2J8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9N2J8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9N2J8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9N2J8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9N2J8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9N2J8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9N2J8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9N2J8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9N2J8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9N2J8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9N2J8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9N2J8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9N2J8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9N2J8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9N2J8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9N2J8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9N2J8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9N2J8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9N2J8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9N2J8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9N2J8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9N2J8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9N2J8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9N2J8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9N2J8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9N2J8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9N2J8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9N2J8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9N2J8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9N2J8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9N2J8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9N2J8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9N2J8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9N2J8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9N2J8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9N2J8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9N2J8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9N2J8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9N2J8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9N2J8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9N2J8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9N2J8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9N2J8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9N2J8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9N2J8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9N2J8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9N2J8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9N2J8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms