Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNCQ9H7C4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNCQ9H7C4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 557.5 ms