Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM38AQ9H6F2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms