Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FNDC4Q9H6D8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNDC4Q9H6D8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms