Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SENP3Q9H4L4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SENP3Q9H4L4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SENP3Q9H4L4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms