Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MFSD1Q9H3U5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MFSD1Q9H3U5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms