Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRMDAQ9H2I8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRMDAQ9H2I8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRMDAQ9H2I8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRMDAQ9H2I8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.5 ms