Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC8Q9H0W5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC8Q9H0W5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC8Q9H0W5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms