Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGIF2Q9GZN2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF2Q9GZN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms