Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J2Q9GZM3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR2J2Q9GZM3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms