Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EDEM3Q9BZQ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms