Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
KDM5DQ9BY66 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM5DQ9BY66 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5DQ9BY66 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5DQ9BY66 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5DQ9BY66 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms