Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGPP1Q9BX95 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGPP1Q9BX95 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms