Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4Q9BWF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4Q9BWF3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms