Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC1Q9BTT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC1Q9BTT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms