Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF649Q9BS31 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF649Q9BS31 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms