Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SDF4Q9BRK5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms