Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED1Q99966 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms