Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRRX2Q99811 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRRX2Q99811 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms