Protein–RNA interactions for Protein: Q99677

LPAR4, Lysophosphatidic acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR4Q99677 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LPAR4Q99677 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPAR4Q99677 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms