Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGRRF1Q99675 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGRRF1Q99675 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms