Protein–RNA interactions for Protein: Q99619

SPSB2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB2Q99619 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB2Q99619 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPSB2Q99619 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB2Q99619 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB2Q99619 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB2Q99619 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB2Q99619 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms