Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CSF3RQ99062 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF3RQ99062 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms