Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX1Q96RV3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX1Q96RV3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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