Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNT1Q96Q11 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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