Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSGA13Q96PP4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSGA13Q96PP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSGA13Q96PP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms