Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRERF1Q96PN7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRERF1Q96PN7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRERF1Q96PN7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRERF1Q96PN7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRERF1Q96PN7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRERF1Q96PN7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRERF1Q96PN7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRERF1Q96PN7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRERF1Q96PN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms