Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD6Q96NE9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD6Q96NE9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms