Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF641Q96N77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF641Q96N77 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF641Q96N77 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF641Q96N77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF641Q96N77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF641Q96N77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF641Q96N77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms