Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF145Q96MT1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms