Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC7Q96M83 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC7Q96M83 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC7Q96M83 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms