Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CABS1Q96KC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms