Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A2Q96JW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A2Q96JW4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A2Q96JW4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A2Q96JW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A2Q96JW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A2Q96JW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A2Q96JW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms