Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46AQ96IP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46AQ96IP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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