Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMD4Q96H15 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMD4Q96H15 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMD4Q96H15 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms