Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT2BQ96GJ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT2BQ96GJ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms