Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RNF185Q96GF1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNF185Q96GF1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF185Q96GF1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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