Protein–RNA interactions for Protein: Q96D05

C10orf35, Uncharacterized protein C10orf35, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf35Q96D05 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C10orf35Q96D05 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C10orf35Q96D05 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf35Q96D05 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms