Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EME1Q96AY2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EME1Q96AY2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms