Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB7BQ96AH8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7BQ96AH8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms