Protein–RNA interactions for Protein: Q96A11

GAL3ST3, Galactose-3-O-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST3Q96A11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAL3ST3Q96A11 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAL3ST3Q96A11 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAL3ST3Q96A11 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms