Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTP4Q969X6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP4Q969X6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms