Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX4Q969G2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX4Q969G2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms