Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP4Q969E2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms