Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-CQ95604 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-CQ95604 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-CQ95604 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms