Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDAQ92838 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDAQ92838 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDAQ92838 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDAQ92838 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDAQ92838 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDAQ92838 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EDAQ92838 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EDAQ92838 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDAQ92838 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDAQ92838 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EDAQ92838 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDAQ92838 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDAQ92838 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDAQ92838 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDAQ92838 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDAQ92838 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDAQ92838 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDAQ92838 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDAQ92838 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDAQ92838 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EDAQ92838 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDAQ92838 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDAQ92838 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDAQ92838 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDAQ92838 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDAQ92838 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDAQ92838 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDAQ92838 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDAQ92838 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDAQ92838 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDAQ92838 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDAQ92838 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDAQ92838 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDAQ92838 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDAQ92838 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDAQ92838 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDAQ92838 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDAQ92838 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDAQ92838 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDAQ92838 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDAQ92838 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDAQ92838 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDAQ92838 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDAQ92838 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDAQ92838 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDAQ92838 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDAQ92838 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDAQ92838 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDAQ92838 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDAQ92838 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDAQ92838 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDAQ92838 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDAQ92838 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDAQ92838 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDAQ92838 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDAQ92838 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDAQ92838 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDAQ92838 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDAQ92838 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EDAQ92838 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDAQ92838 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDAQ92838 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDAQ92838 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDAQ92838 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EDAQ92838 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDAQ92838 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDAQ92838 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDAQ92838 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDAQ92838 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDAQ92838 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDAQ92838 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDAQ92838 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDAQ92838 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDAQ92838 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDAQ92838 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDAQ92838 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDAQ92838 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDAQ92838 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDAQ92838 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDAQ92838 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDAQ92838 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EDAQ92838 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDAQ92838 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDAQ92838 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDAQ92838 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDAQ92838 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDAQ92838 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDAQ92838 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDAQ92838 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDAQ92838 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 605.2 ms