Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NCSTNQ92542 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCSTNQ92542 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms