Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PSPC1Q8WXF1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSPC1Q8WXF1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSPC1Q8WXF1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 441 ms