Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1Q8WVP7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms